Desde el Senado de la República, Alfonso Cepeda Salas operó para que se aprobara una reforma a la Ley Federal de los Trabajadores al Servicio del Estado, para que se garantice la autonomía de los organismos sindicales.

Con dicha reforma, el líder del SNTE logró que los servidores públicos sean sancionados con suspensión temporal del cargo, destitución o inhabilitación de uno a 20 años, así como sanciones económicas, cuando intervengan en la vida interna de los sindicatos.